Depuis juin 2000, le Comité français de l’UICN organise annuellement le Congrès français de la nature qui réunit ses organismes membres, ses experts et ses partenaires pour débattre des priorités et enjeux de la biodiversité en France et dans le monde.
Depuis la première édition du Congrès français de la nature, des recommandations ont été présentées et adoptées en fonction des travaux réalisés dans les commissions et groupes de travail du Comité français de l’UICN.
Deux congrès (2000 et 2004) ont servi à préparer les propositions françaises pour le congrès mondial de la nature, organisé tous les 4 ans par l’UICN. Les autres congrès ont validé des recommandations, principalement à l’attention du gouvernement français.
Le 6ème congrès français de la nature a débattu de recommandations sur les plans d’action de la stratégie nationale pour la biodiversité. Un sondage exclusif sur les français et la biodiversité a aussi été présenté, dont les résultats ont servi à alimenter un débat sur la biodiversité avec des représentants des parlementaires, des collectivités locales, des entreprises, des médias, des scientifiques, des ONG et du gouvernement.
Le 7ème congrès (13 décembre 2006) a rassemblé plus de 250 participants sur le thème "Politique et biodiversité : quelles propositions pour 2007 ?".
Les représentants des grandes ONG, membres de l’UICN, ont présenté les intiatives qu’elles ont lancées pour les élections de 2007. L’UICN France a présenté également sa contribution à la préparation de cette importante échéance politique.
L’après-midi, le grand événement de 2007, la Fête de la Nature, a été présenté aux participants ainsi que les principaux points forts des activités de l’UICN France en 2006. Après une allocution de la Ministre de l’Ecologie, le premier bilan de la stratégie nationale de la biodiversité a été exposé par le ministère, avec l’analyse critique de l’UICN France, ainsi que les progrès fait au niveau international pour répondre à l’objectif 2010 visant à enrayer la disparition de la biodiversité.
Le Comité français a organisé le 8ème Congrès français de la nature en mai 2008. Ce congrès a permis d’adopter la Charte de l’expert du Comité français de l’UICN ainsi que les 7 projets de recommandation présentés par les membres français au congrès mondial de l’UICN (Barcelone, octobre 2008).